Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDV3Q9UKY7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDV3Q9UKY7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDV3Q9UKY7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDV3Q9UKY7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDV3Q9UKY7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDV3Q9UKY7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDV3Q9UKY7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDV3Q9UKY7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDV3Q9UKY7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDV3Q9UKY7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDV3Q9UKY7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms