Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC23Q9UJX2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC23Q9UJX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC23Q9UJX2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC23Q9UJX2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms