Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCF20Q9UGU0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCF20Q9UGU0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCF20Q9UGU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms