Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
CC2D2AQ9P2K1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC46.03■■■■■ 4.96
CC2D2AQ9P2K1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
CC2D2AQ9P2K1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC45.95■■■■■ 4.95
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC45.93■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
CC2D2AQ9P2K1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC45.86■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
CC2D2AQ9P2K1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC45.81■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC45.76■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
CC2D2AQ9P2K1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC45.75■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CC2D2AQ9P2K1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC45.67■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
CC2D2AQ9P2K1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.2 ms