Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAH9Q9NYC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAH9Q9NYC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAH9Q9NYC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms