Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM8Q9NQV8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM8Q9NQV8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM8Q9NQV8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM8Q9NQV8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM8Q9NQV8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms