Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP140LQ9H930 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP140LQ9H930 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140LQ9H930 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms