Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHCBP1LQ9BZQ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHCBP1LQ9BZQ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHCBP1LQ9BZQ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms