Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC6Q96SB8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC6Q96SB8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC6Q96SB8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC6Q96SB8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC6Q96SB8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC6Q96SB8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC6Q96SB8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms