Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX4Q969G2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX4Q969G2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms