Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3BQ8TF42 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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