Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCOLN3Q8TDD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCOLN3Q8TDD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCOLN3Q8TDD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCOLN3Q8TDD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms