Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LTBP4Q8N2S1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
LTBP4Q8N2S1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.29
LTBP4Q8N2S1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LTBP4Q8N2S1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LTBP4Q8N2S1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms