Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
STRCQ7RTU9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
STRCQ7RTU9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
STRCQ7RTU9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
STRCQ7RTU9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
STRCQ7RTU9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
STRCQ7RTU9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
STRCQ7RTU9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
STRCQ7RTU9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
STRCQ7RTU9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
STRCQ7RTU9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
STRCQ7RTU9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
STRCQ7RTU9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
STRCQ7RTU9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms