Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSBN1Q5VWQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSBN1Q5VWQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSBN1Q5VWQ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms