Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WASHC2DQ5SRD0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
WASHC2DQ5SRD0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms