Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EMC4Q5J8M3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMC4Q5J8M3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms