Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MLH1-207ENST00000441265 917 ntTSL 56.34□□□□□ -1.392e-14■■■■■ 60
PCBP2Q15366 MLH1-215ENST00000458009 660 ntTSL 1 (best)5.98□□□□□ -1.452e-14■■■■■ 60
PCBP2Q15366 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.462e-14■■■■■ 60
PCBP2Q15366 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.512e-14■■■■■ 60
PCBP2Q15366 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.752e-14■■■■■ 60
PCBP2Q15366 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 60
PCBP2Q15366 PPP1R13B-212ENST00000556325 546 ntTSL 510.55□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 60
PCBP2Q15366 PPP1R13B-209ENST00000555734 504 ntTSL 39.9□□□□□ -0.821e-10■■■■■ 60
PCBP2Q15366 PPP1R13B-215ENST00000557082 4254 ntTSL 58.68□□□□□ -1.021e-10■■■■■ 60
PCBP2Q15366 PPP1R13B-203ENST00000554106 551 ntTSL 48.41□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 60
PCBP2Q15366 FAM160A1-204ENST00000508198 604 ntTSL 416.11■□□□□ 0.172e-17■■■■■ 59.8
PCBP2Q15366 FAM160A1-202ENST00000503146 570 ntTSL 515.64■□□□□ 0.092e-17■■■■■ 59.8
PCBP2Q15366 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.452e-17■■■■■ 59.8
PCBP2Q15366 FAM160A1-205ENST00000511501 304 ntTSL 310.87□□□□□ -0.672e-17■■■■■ 59.8
PCBP2Q15366 FAM160A1-206ENST00000512597 548 ntTSL 48.25□□□□□ -1.092e-17■■■■■ 59.8
PCBP2Q15366 FAM160A1-207ENST00000513086 401 ntTSL 26.81□□□□□ -1.322e-17■■■■■ 59.8
PCBP2Q15366 FAM160A1-208ENST00000513962 565 ntTSL 45.94□□□□□ -1.462e-17■■■■■ 59.8
PCBP2Q15366 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 59.7
PCBP2Q15366 R3HDM4-205ENST00000589445 705 ntTSL 321.49■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 59.7
PCBP2Q15366 R3HDM4-206ENST00000590454 1006 ntTSL 320.51■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 59.7
PCBP2Q15366 HSD3B7-204ENST00000574447 746 ntTSL 316.33■□□□□ 0.22e-16■■■■■ 59.7
PCBP2Q15366 HSD3B7-203ENST00000562932 746 ntTSL 514.46□□□□□ -0.092e-16■■■■■ 59.7
PCBP2Q15366 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-9■■■■■ 59.6
PCBP2Q15366 TBC1D8-209ENST00000487392 373 ntTSL 512.85□□□□□ -0.354e-9■■■■■ 59.6
PCBP2Q15366 CDK18-206ENST00000462976 794 ntTSL 522.07■■□□□ 1.121e-8■■■■■ 59.4
PCBP2Q15366 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.891e-8■■■■■ 59.4
PCBP2Q15366 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 59.4
PCBP2Q15366 CDK18-204ENST00000443813 591 ntTSL 418.42■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 59.4
PCBP2Q15366 CDK18-209ENST00000478560 782 ntTSL 518.1■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 59.4
PCBP2Q15366 CDK18-221ENST00000512922 1134 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 59.4
PCBP2Q15366 CDK18-218ENST00000507067 342 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 59.4
PCBP2Q15366 CDK18-213ENST00000504648 2435 ntTSL 216.64■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 59.4
PCBP2Q15366 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 56.92□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 59.3
PCBP2Q15366 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 59.3
PCBP2Q15366 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 59.3
PCBP2Q15366 NCOR1-210ENST00000458113 3490 ntTSL 28.86□□□□□ -0.991e-14■■■■■ 59.3
PCBP2Q15366 NCOR1-203ENST00000395849 3419 ntTSL 28.31□□□□□ -1.081e-14■■■■■ 59.3
PCBP2Q15366 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.311e-14■■■■■ 59.3
PCBP2Q15366 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.371e-14■■■■■ 59.3
PCBP2Q15366 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.381e-14■■■■■ 59.3
PCBP2Q15366 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 513.6□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 59.2
PCBP2Q15366 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.721e-11■■■■■ 59.1
PCBP2Q15366 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.692e-8■■■■■ 59.1
PCBP2Q15366 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 59.1
PCBP2Q15366 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 59
PCBP2Q15366 CEP83-207ENST00000547232 2166 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 59
PCBP2Q15366 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 59
PCBP2Q15366 ITPR2-201ENST00000242737 581 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-10■■■■■ 59
PCBP2Q15366 ITPR2-209ENST00000545235 540 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.182e-10■■■■■ 59
PCBP2Q15366 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 59
PCBP2Q15366 LPP-202ENST00000415906 888 ntTSL 27.94□□□□□ -1.144e-8■■■■■ 58.9
PCBP2Q15366 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 58.9
PCBP2Q15366 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 58.9
PCBP2Q15366 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.845e-17■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.365e-17■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 RGS12-210ENST00000506631 1530 ntTSL 1 (best)23.12■■□□□ 1.293e-7■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 RGS12-224ENST00000514268 2751 ntTSL 518.53■□□□□ 0.563e-7■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 RGS12-222ENST00000513784 710 ntTSL 215.86■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 RGS12-219ENST00000511805 552 ntTSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.433e-7■■■■■ 58.8
PCBP2Q15366 VRK1-204ENST00000555351 667 ntTSL 211.08□□□□□ -0.649e-13■■■■■ 58.5
PCBP2Q15366 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 58.5
PCBP2Q15366 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.616e-13■■■■■ 58.4
PCBP2Q15366 PABPC1L-216ENST00000490798 1384 ntTSL 318.3■□□□□ 0.526e-13■■■■■ 58.4
PCBP2Q15366 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.426e-13■■■■■ 58.4
PCBP2Q15366 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.356e-13■■■■■ 58.4
PCBP2Q15366 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 510.94□□□□□ -0.666e-13■■■■■ 58.4
PCBP2Q15366 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 58.4
PCBP2Q15366 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 58.4
PCBP2Q15366 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 58.4
PCBP2Q15366 ZNF444-204ENST00000587236 5565 ntTSL 215.42■□□□□ 0.061e-35■■■■■ 58.3
PCBP2Q15366 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.724e-14■■■■■ 58.3
PCBP2Q15366 BNIP3-204ENST00000633835 1062 ntTSL 319.56■□□□□ 0.724e-14■■■■■ 58.3
PCBP2Q15366 KRT19-202ENST00000455635 641 ntTSL 317.89■□□□□ 0.454e-14■■■■■ 58.3
PCBP2Q15366 BNIP3-203ENST00000631806 752 ntTSL 214.21□□□□□ -0.134e-14■■■■■ 58.3
PCBP2Q15366 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-14■■■■■ 58.3
PCBP2Q15366 BNIP3-202ENST00000540159 3066 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.274e-14■■■■■ 58.3
PCBP2Q15366 ZRANB3-205ENST00000452187 1269 ntTSL 510.59□□□□□ -0.719e-7■■■■■ 58.2
PCBP2Q15366 ZRANB3-208ENST00000492193 546 ntTSL 38.53□□□□□ -1.049e-7■■■■■ 58.2
PCBP2Q15366 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 58.2
PCBP2Q15366 KIZ-205ENST00000611685 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.1■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 58.2
PCBP2Q15366 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 58.2
PCBP2Q15366 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 58.2
PCBP2Q15366 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 58.2
PCBP2Q15366 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)7.88□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 58.1
PCBP2Q15366 GNAQ-202ENST00000411677 551 ntTSL 39.41□□□□□ -0.92e-10■■■■■ 58.1
PCBP2Q15366 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 58.1
PCBP2Q15366 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.464e-8■■■■■ 58.1
PCBP2Q15366 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.394e-8■■■■■ 58.1
PCBP2Q15366 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.284e-8■■■■■ 58.1
PCBP2Q15366 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.414e-8■■■■■ 58.1
PCBP2Q15366 FBXO31-203ENST00000563956 548 ntTSL 322.27■■□□□ 1.166e-9■■■■■ 58
PCBP2Q15366 FBXO31-206ENST00000569412 431 ntTSL 54.68□□□□□ -1.666e-9■■■■■ 58
PCBP2Q15366 RAB5B-203ENST00000546810 589 ntTSL 212.77□□□□□ -0.379e-8■■■■■ 57.9
PCBP2Q15366 RAB5B-204ENST00000548068 596 ntTSL 412.13□□□□□ -0.479e-8■■■■■ 57.9
PCBP2Q15366 RAB5B-209ENST00000551459 569 ntTSL 45.78□□□□□ -1.489e-8■■■■■ 57.9
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