Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
R3HDM1Q15032 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
R3HDM1Q15032 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
R3HDM1Q15032 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
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