Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MADCAM1Q13477 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MADCAM1Q13477 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms