Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 MPC2YHR162W 390 nt10.4□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 SGF29YCL010C 780 nt10.4□□□□□ -0.74
TY2B-BQ12491 HIS1YER055C 894 nt10.39□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 VPS24YKL041W 675 nt10.39□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 ECM19YLR390W 339 nt10.39□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 SUR7YML052W 909 nt10.39□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 DOT1YDR440W 1749 nt10.39□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 SNF7YLR025W 723 nt10.38□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 YNL017CYNL017C 339 nt10.37□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 ADE2YOR128C 1716 nt10.37□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 RUP1YOR138C 2016 nt10.37□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt10.37□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 YDL218WYDL218W 954 nt10.36□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 MSO1YNR049C 633 nt10.36□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 VBA5YKR105C 1749 nt10.34□□□□□ -0.75
TY2B-BQ12491 DUR3YHL016C 2208 nt10.33□□□□□ -0.76
TY2B-BQ12491 SYF2YGR129W 648 nt10.33□□□□□ -0.76
TY2B-BQ12491 TCB1YOR086C 3561 nt10.31□□□□□ -0.76
TY2B-BQ12491 HBS1YKR084C 1836 nt10.31□□□□□ -0.76
TY2B-BQ12491 ZRT2YLR130C 1269 nt10.31□□□□□ -0.76
TY2B-BQ12491 CBR1YIL043C 855 nt10.3□□□□□ -0.76
TY2B-BQ12491 KSH1YNL024C-A 219 nt10.3□□□□□ -0.76
TY2B-BQ12491 ENV7YPL236C 1095 nt10.29□□□□□ -0.76
TY2B-BQ12491 YLR126CYLR126C 756 nt10.27□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 SNN1YNL086W 309 nt10.27□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 DID2YKR035W-A 615 nt10.26□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 PSR2YLR019W 1194 nt10.26□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 SGF73YGL066W 1974 nt10.26□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 SDH4YDR178W 546 nt10.26□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 DFM1YDR411C 1026 nt10.26□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 YHK8YHR048W 1545 nt10.26□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 ERG1YGR175C 1491 nt10.25□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 IRC5YFR038W 2562 nt10.25□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 YDL172CYDL172C 480 nt10.25□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 SIT4YDL047W 936 nt10.24□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 RSC9YML127W 1746 nt10.24□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 EXG2YDR261C 1689 nt10.24□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 HEL2YDR266C 1920 nt10.24□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 COQ1YBR003W 1422 nt10.24□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 SWD1YAR003W 1281 nt10.24□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 ELA1YNL230C 1140 nt10.24□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 FRA1YLL029W 2250 nt10.23□□□□□ -0.77
TY2B-BQ12491 PRY3YJL078C 2646 nt10.23□□□□□ -0.77
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TY2B-BQ12491 MTF2YDL044C 1323 nt10.21□□□□□ -0.78
TY2B-BQ12491 PHO85YPL031C 918 nt10.21□□□□□ -0.78
TY2B-BQ12491 NUP57YGR119C 1626 nt10.21□□□□□ -0.78
TY2B-BQ12491 NHA1YLR138W 2958 nt10.21□□□□□ -0.78
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TY2B-BQ12491 SHP1YBL058W 1272 nt10.17□□□□□ -0.78
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TY2B-BQ12491 MDH2YOL126C 1134 nt10.16□□□□□ -0.78
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TY2B-BQ12491 BUD32YGR262C 786 nt10.08□□□□□ -0.8
TY2B-BQ12491 UTP4YDR324C 2331 nt10.08□□□□□ -0.8
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TY2B-BQ12491 TIM22YDL217C 624 nt10.07□□□□□ -0.8
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TY2B-BQ12491 MRPS28YDR337W 861 nt10.04□□□□□ -0.8
TY2B-BQ12491 TRS31YDR472W 852 nt10.04□□□□□ -0.8
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TY2B-BQ12491 OGG1YML060W 1131 nt10.03□□□□□ -0.8
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TY2B-BQ12491 HSV2YGR223C 1347 nt10.02□□□□□ -0.81
TY2B-BQ12491 LYS1YIR034C 1122 nt10.02□□□□□ -0.81
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