Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTN3Q08043 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN3Q08043 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1262 ms