Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TAP1Q03518 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAP1Q03518 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms