Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX1P78414 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX1P78414 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX1P78414 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX1P78414 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX1P78414 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX1P78414 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX1P78414 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX1P78414 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX1P78414 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX1P78414 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX1P78414 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX1P78414 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX1P78414 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX1P78414 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX1P78414 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX1P78414 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX1P78414 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX1P78414 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX1P78414 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX1P78414 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX1P78414 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX1P78414 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX1P78414 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX1P78414 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX1P78414 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX1P78414 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX1P78414 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX1P78414 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX1P78414 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX1P78414 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX1P78414 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX1P78414 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX1P78414 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX1P78414 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX1P78414 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX1P78414 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX1P78414 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX1P78414 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX1P78414 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX1P78414 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX1P78414 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX1P78414 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX1P78414 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX1P78414 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX1P78414 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX1P78414 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX1P78414 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IRX1P78414 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX1P78414 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX1P78414 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX1P78414 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX1P78414 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX1P78414 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX1P78414 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX1P78414 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX1P78414 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX1P78414 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX1P78414 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX1P78414 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX1P78414 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX1P78414 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX1P78414 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX1P78414 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX1P78414 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX1P78414 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX1P78414 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX1P78414 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX1P78414 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX1P78414 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX1P78414 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX1P78414 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX1P78414 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX1P78414 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX1P78414 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX1P78414 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX1P78414 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX1P78414 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX1P78414 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX1P78414 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX1P78414 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX1P78414 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX1P78414 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX1P78414 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX1P78414 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX1P78414 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX1P78414 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX1P78414 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX1P78414 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX1P78414 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX1P78414 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX1P78414 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX1P78414 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX1P78414 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX1P78414 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX1P78414 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX1P78414 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX1P78414 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX1P78414 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX1P78414 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms