Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELLP55199 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELLP55199 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELLP55199 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELLP55199 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELLP55199 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELLP55199 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELLP55199 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELLP55199 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELLP55199 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ELLP55199 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ELLP55199 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ELLP55199 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ELLP55199 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ELLP55199 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ELLP55199 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ELLP55199 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ELLP55199 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ELLP55199 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELLP55199 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELLP55199 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELLP55199 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELLP55199 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELLP55199 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELLP55199 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELLP55199 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELLP55199 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ELLP55199 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ELLP55199 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ELLP55199 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ELLP55199 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ELLP55199 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ELLP55199 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ELLP55199 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ELLP55199 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ELLP55199 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ELLP55199 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ELLP55199 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ELLP55199 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ELLP55199 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ELLP55199 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ELLP55199 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ELLP55199 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ELLP55199 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ELLP55199 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ELLP55199 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ELLP55199 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ELLP55199 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ELLP55199 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ELLP55199 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ELLP55199 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ELLP55199 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ELLP55199 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ELLP55199 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ELLP55199 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ELLP55199 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ELLP55199 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ELLP55199 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ELLP55199 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ELLP55199 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ELLP55199 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ELLP55199 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ELLP55199 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ELLP55199 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ELLP55199 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ELLP55199 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ELLP55199 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ELLP55199 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ELLP55199 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ELLP55199 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ELLP55199 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ELLP55199 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ELLP55199 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ELLP55199 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ELLP55199 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ELLP55199 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ELLP55199 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ELLP55199 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ELLP55199 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ELLP55199 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ELLP55199 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ELLP55199 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ELLP55199 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ELLP55199 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ELLP55199 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ELLP55199 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ELLP55199 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ELLP55199 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ELLP55199 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ELLP55199 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ELLP55199 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ELLP55199 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ELLP55199 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ELLP55199 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ELLP55199 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ELLP55199 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ELLP55199 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ELLP55199 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ELLP55199 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ELLP55199 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms