Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUDT6P53370 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDT6P53370 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDT6P53370 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUDT6P53370 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms