Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VEGFBP49765 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VEGFBP49765 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VEGFBP49765 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
VEGFBP49765 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms