Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NESP48681 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NESP48681 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NESP48681 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NESP48681 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NESP48681 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NESP48681 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NESP48681 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NESP48681 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
NESP48681 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
NESP48681 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
NESP48681 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
NESP48681 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NESP48681 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
NESP48681 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NESP48681 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
NESP48681 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
NESP48681 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NESP48681 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
NESP48681 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
NESP48681 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NESP48681 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
NESP48681 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
NESP48681 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
NESP48681 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NESP48681 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
NESP48681 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NESP48681 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NESP48681 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NESP48681 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NESP48681 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NESP48681 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
NESP48681 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
NESP48681 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
NESP48681 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
NESP48681 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
NESP48681 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
NESP48681 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
NESP48681 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NESP48681 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NESP48681 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NESP48681 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
NESP48681 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
NESP48681 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
NESP48681 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
NESP48681 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
NESP48681 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
NESP48681 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.91■■■■■ 4.62
NESP48681 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
NESP48681 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
NESP48681 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
NESP48681 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
NESP48681 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
NESP48681 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
NESP48681 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
NESP48681 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
NESP48681 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
NESP48681 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
NESP48681 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
NESP48681 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
NESP48681 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
NESP48681 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
NESP48681 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
NESP48681 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NESP48681 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
NESP48681 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NESP48681 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
NESP48681 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
NESP48681 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
NESP48681 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
NESP48681 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
NESP48681 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
NESP48681 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
NESP48681 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
NESP48681 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
NESP48681 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
NESP48681 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
NESP48681 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
NESP48681 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC43.79■■■■■ 4.6
NESP48681 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
NESP48681 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
NESP48681 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
NESP48681 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
NESP48681 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
NESP48681 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
NESP48681 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
NESP48681 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
NESP48681 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
NESP48681 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
NESP48681 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
NESP48681 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
NESP48681 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
NESP48681 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
NESP48681 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
NESP48681 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
NESP48681 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
NESP48681 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
NESP48681 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
NESP48681 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
NESP48681 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms