Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD8P48556 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD8P48556 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD8P48556 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms