Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX3P48380 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX3P48380 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX3P48380 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX3P48380 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX3P48380 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX3P48380 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX3P48380 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX3P48380 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX3P48380 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX3P48380 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX3P48380 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX3P48380 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX3P48380 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX3P48380 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX3P48380 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX3P48380 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX3P48380 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX3P48380 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX3P48380 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX3P48380 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX3P48380 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX3P48380 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX3P48380 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX3P48380 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX3P48380 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX3P48380 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX3P48380 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX3P48380 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RFX3P48380 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX3P48380 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX3P48380 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX3P48380 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX3P48380 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX3P48380 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX3P48380 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX3P48380 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX3P48380 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX3P48380 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX3P48380 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX3P48380 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX3P48380 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX3P48380 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX3P48380 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX3P48380 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX3P48380 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX3P48380 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX3P48380 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX3P48380 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX3P48380 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX3P48380 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX3P48380 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX3P48380 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX3P48380 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX3P48380 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX3P48380 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX3P48380 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX3P48380 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX3P48380 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX3P48380 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX3P48380 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX3P48380 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX3P48380 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX3P48380 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX3P48380 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX3P48380 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX3P48380 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX3P48380 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX3P48380 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX3P48380 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX3P48380 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX3P48380 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX3P48380 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX3P48380 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX3P48380 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX3P48380 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX3P48380 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX3P48380 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX3P48380 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX3P48380 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms