Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5AP29375 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM5AP29375 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5AP29375 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5AP29375 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5AP29375 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms