Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD34P28906 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD34P28906 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD34P28906 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD34P28906 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD34P28906 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD34P28906 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD34P28906 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD34P28906 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD34P28906 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD34P28906 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CD34P28906 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD34P28906 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD34P28906 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD34P28906 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD34P28906 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD34P28906 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD34P28906 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD34P28906 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD34P28906 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD34P28906 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD34P28906 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CD34P28906 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CD34P28906 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CD34P28906 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CD34P28906 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CD34P28906 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CD34P28906 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD34P28906 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD34P28906 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD34P28906 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD34P28906 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD34P28906 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD34P28906 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD34P28906 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD34P28906 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD34P28906 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD34P28906 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD34P28906 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD34P28906 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD34P28906 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD34P28906 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD34P28906 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD34P28906 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD34P28906 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD34P28906 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD34P28906 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD34P28906 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD34P28906 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD34P28906 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD34P28906 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD34P28906 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD34P28906 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD34P28906 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD34P28906 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD34P28906 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD34P28906 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD34P28906 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD34P28906 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD34P28906 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD34P28906 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD34P28906 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD34P28906 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD34P28906 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD34P28906 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD34P28906 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD34P28906 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD34P28906 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD34P28906 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD34P28906 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD34P28906 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD34P28906 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CD34P28906 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD34P28906 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD34P28906 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD34P28906 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD34P28906 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CD34P28906 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CD34P28906 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD34P28906 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD34P28906 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD34P28906 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD34P28906 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD34P28906 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms