Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA2P20248 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA2P20248 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms