Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DESP17661 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DESP17661 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DESP17661 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DESP17661 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DESP17661 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DESP17661 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DESP17661 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DESP17661 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DESP17661 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DESP17661 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DESP17661 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DESP17661 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DESP17661 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DESP17661 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DESP17661 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DESP17661 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DESP17661 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DESP17661 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DESP17661 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DESP17661 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DESP17661 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DESP17661 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DESP17661 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DESP17661 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DESP17661 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DESP17661 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DESP17661 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DESP17661 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DESP17661 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DESP17661 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DESP17661 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DESP17661 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DESP17661 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DESP17661 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DESP17661 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DESP17661 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DESP17661 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DESP17661 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DESP17661 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DESP17661 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DESP17661 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DESP17661 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DESP17661 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DESP17661 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DESP17661 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DESP17661 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DESP17661 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DESP17661 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DESP17661 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DESP17661 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DESP17661 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DESP17661 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DESP17661 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DESP17661 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DESP17661 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DESP17661 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DESP17661 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DESP17661 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DESP17661 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DESP17661 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DESP17661 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DESP17661 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DESP17661 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DESP17661 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DESP17661 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DESP17661 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DESP17661 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DESP17661 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DESP17661 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DESP17661 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DESP17661 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DESP17661 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DESP17661 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DESP17661 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DESP17661 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DESP17661 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DESP17661 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DESP17661 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DESP17661 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DESP17661 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DESP17661 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DESP17661 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DESP17661 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DESP17661 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DESP17661 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DESP17661 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DESP17661 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DESP17661 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DESP17661 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DESP17661 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DESP17661 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DESP17661 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DESP17661 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DESP17661 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DESP17661 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DESP17661 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DESP17661 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DESP17661 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DESP17661 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms