Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBL4AP11441 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBL4AP11441 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL4AP11441 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms