Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKHD1P08F94 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKHD1P08F94 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms