Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EIF3JO75822 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EIF3JO75822 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3JO75822 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3JO75822 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms