Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC22O60826 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC22O60826 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC22O60826 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms