Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A20O43772 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A20O43772 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.7 ms