Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCSO14618 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCSO14618 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCSO14618 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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