Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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