RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577092.1

HOXB1-202, Transcript of homeobox B1, humanhuman

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Gene HOXB1, Length 1,414 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1-202ENST00000577092 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.18■■■■■ 4.66
HOXB1-202ENST00000577092 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.1■■■■□ 3.85
HOXB1-202ENST00000577092 ABCC9O60706 1549 aa37.47■■■■□ 3.59
HOXB1-202ENST00000577092 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
HOXB1-202ENST00000577092 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.69■■■■□ 3.46
HOXB1-202ENST00000577092 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.64■■■■□ 3.46
HOXB1-202ENST00000577092 NACADO15069 1562 aa36.58■■■■□ 3.45
HOXB1-202ENST00000577092 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.45■■■■□ 3.43
HOXB1-202ENST00000577092 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.45■■■■□ 3.43
HOXB1-202ENST00000577092 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.63■■■■□ 3.29
HOXB1-202ENST00000577092 SCRIBQ14160 1630 aa35.56■■■■□ 3.28
HOXB1-202ENST00000577092 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB1-202ENST00000577092 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.11■■■■□ 3.21
HOXB1-202ENST00000577092 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.05■■■■□ 3.2
HOXB1-202ENST00000577092 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
HOXB1-202ENST00000577092 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXB1-202ENST00000577092 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
HOXB1-202ENST00000577092 SMARCA4P51532 1647 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXB1-202ENST00000577092 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXB1-202ENST00000577092 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34■■■■□ 3.03
HOXB1-202ENST00000577092 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXB1-202ENST00000577092 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
HOXB1-202ENST00000577092 SMARCA2P51531 1590 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXB1-202ENST00000577092 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.79■■■■□ 3
HOXB1-202ENST00000577092 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.79■■■■□ 3
HOXB1-202ENST00000577092 NCAPD3P42695 1498 aa33.73■■■□□ 2.99
HOXB1-202ENST00000577092 WIZO95785 1651 aa33.67■■■□□ 2.98
HOXB1-202ENST00000577092 HMGXB3Q12766 1538 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXB1-202ENST00000577092 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
HOXB1-202ENST00000577092 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
HOXB1-202ENST00000577092 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
HOXB1-202ENST00000577092 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.96■■■□□ 2.87
HOXB1-202ENST00000577092 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXB1-202ENST00000577092 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.73■■■□□ 2.83
HOXB1-202ENST00000577092 CFTRP13569 1480 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXB1-202ENST00000577092 NESP48681 1621 aa32.61■■■□□ 2.81
HOXB1-202ENST00000577092 PRDM2Q13029 1718 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXB1-202ENST00000577092 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXB1-202ENST00000577092 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXB1-202ENST00000577092 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.32■■■□□ 2.76
HOXB1-202ENST00000577092 ERCC6Q03468 1493 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXB1-202ENST00000577092 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXB1-202ENST00000577092 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.09■■■□□ 2.73
HOXB1-202ENST00000577092 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
HOXB1-202ENST00000577092 ABCC8Q09428 1581 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXB1-202ENST00000577092 WDR62O43379 1518 aa31.99■■■□□ 2.71
HOXB1-202ENST00000577092 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
HOXB1-202ENST00000577092 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXB1-202ENST00000577092 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.91■■■□□ 2.7
HOXB1-202ENST00000577092 TOPBP1Q92547 1522 aa31.9■■■□□ 2.7
HOXB1-202ENST00000577092 CUX1P39880 1505 aa31.88■■■□□ 2.69
HOXB1-202ENST00000577092 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXB1-202ENST00000577092 TOP2BQ02880 1626 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXB1-202ENST00000577092 CUX2O14529 1486 aa31.81■■■□□ 2.68
HOXB1-202ENST00000577092 SYNJ1O43426 1573 aa31.79■■■□□ 2.68
HOXB1-202ENST00000577092 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
HOXB1-202ENST00000577092 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXB1-202ENST00000577092 IFT140Q96RY7 1462 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXB1-202ENST00000577092 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
HOXB1-202ENST00000577092 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB1-202ENST00000577092 SOGA1O94964 1423 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB1-202ENST00000577092 TRIM41Q8WV44 630 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXB1-202ENST00000577092 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXB1-202ENST00000577092 WDR97A6NE52 1622 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXB1-202ENST00000577092 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.45■■■□□ 2.62
HOXB1-202ENST00000577092 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
HOXB1-202ENST00000577092 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
HOXB1-202ENST00000577092 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXB1-202ENST00000577092 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
HOXB1-202ENST00000577092 KIF27Q86VH2 1401 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXB1-202ENST00000577092 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
HOXB1-202ENST00000577092 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.2■■■□□ 2.59
HOXB1-202ENST00000577092 GRIN2BQ13224 1484 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXB1-202ENST00000577092 PBRM1Q86U86 1689 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXB1-202ENST00000577092 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXB1-202ENST00000577092 EEA1Q15075 1411 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXB1-202ENST00000577092 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXB1-202ENST00000577092 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
HOXB1-202ENST00000577092 IGF1RP08069 1367 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXB1-202ENST00000577092 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB1-202ENST00000577092 CUL7Q14999 1698 aa30.95■■■□□ 2.54
HOXB1-202ENST00000577092 ADAMTS12P58397 1594 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB1-202ENST00000577092 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB1-202ENST00000577092 SYNJ2O15056 1496 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB1-202ENST00000577092 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXB1-202ENST00000577092 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXB1-202ENST00000577092 PRXQ9BXM0 1461 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXB1-202ENST00000577092 CHD1O14646 1710 aa30.76■■■□□ 2.52
HOXB1-202ENST00000577092 GRIN2AQ12879 1464 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXB1-202ENST00000577092 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
HOXB1-202ENST00000577092 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.72■■■□□ 2.51
HOXB1-202ENST00000577092 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
HOXB1-202ENST00000577092 KIF21BO75037 1637 aa30.69■■■□□ 2.5
HOXB1-202ENST00000577092 FBLN2P98095 1184 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB1-202ENST00000577092 NUP160Q12769 1436 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB1-202ENST00000577092 CEP170Q5SW79 1584 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXB1-202ENST00000577092 OSCARQ8IYS5 282 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXB1-202ENST00000577092 GOLGA3Q08378 1498 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXB1-202ENST00000577092 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXB1-202ENST00000577092 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.45■■■□□ 2.47
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