Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC24CP53992 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms