Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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