RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268151.11

MFGE8-202, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MFGE8, Length 1,752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-202ENST00000268151 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.02■■■■■ 4
MFGE8-202ENST00000268151 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.69■■■■□ 3.14
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MFGE8-202ENST00000268151 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.11■■■□□ 2.89
MFGE8-202ENST00000268151 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.98■■■□□ 2.87
MFGE8-202ENST00000268151 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.84■■■□□ 2.85
MFGE8-202ENST00000268151 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.61■■■□□ 2.81
MFGE8-202ENST00000268151 ABCC9O60706 1549 aa32.59■■■□□ 2.81
MFGE8-202ENST00000268151 NACADO15069 1562 aa32.3■■■□□ 2.76
MFGE8-202ENST00000268151 SCRIBQ14160 1630 aa31.94■■■□□ 2.7
MFGE8-202ENST00000268151 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.93■■■□□ 2.7
MFGE8-202ENST00000268151 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
MFGE8-202ENST00000268151 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.19■■■□□ 2.58
MFGE8-202ENST00000268151 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
MFGE8-202ENST00000268151 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.07■■■□□ 2.56
MFGE8-202ENST00000268151 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.95■■■□□ 2.55
MFGE8-202ENST00000268151 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.92■■■□□ 2.54
MFGE8-202ENST00000268151 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
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MFGE8-202ENST00000268151 WIZO95785 1651 aa30.64■■■□□ 2.5
MFGE8-202ENST00000268151 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.61■■■□□ 2.49
MFGE8-202ENST00000268151 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
MFGE8-202ENST00000268151 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.3■■■□□ 2.44
MFGE8-202ENST00000268151 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.13■■■□□ 2.41
MFGE8-202ENST00000268151 SMARCA2P51531 1590 aa30.1■■■□□ 2.41
MFGE8-202ENST00000268151 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.09■■■□□ 2.41
MFGE8-202ENST00000268151 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
MFGE8-202ENST00000268151 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
MFGE8-202ENST00000268151 TRIM41Q8WV44 630 aa29.9■■■□□ 2.38
MFGE8-202ENST00000268151 NCAPD3P42695 1498 aa29.85■■■□□ 2.37
MFGE8-202ENST00000268151 HMGXB3Q12766 1538 aa29.78■■■□□ 2.36
MFGE8-202ENST00000268151 ABCC8Q09428 1581 aa29.5■■■□□ 2.31
MFGE8-202ENST00000268151 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.46■■■□□ 2.31
MFGE8-202ENST00000268151 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.44■■■□□ 2.3
MFGE8-202ENST00000268151 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
MFGE8-202ENST00000268151 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
MFGE8-202ENST00000268151 CFTRP13569 1480 aa29.25■■■□□ 2.27
MFGE8-202ENST00000268151 SYNJ1O43426 1573 aa29.15■■■□□ 2.26
MFGE8-202ENST00000268151 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.11■■■□□ 2.25
MFGE8-202ENST00000268151 EEA1Q15075 1411 aa29.1■■■□□ 2.25
MFGE8-202ENST00000268151 SOGA1O94964 1423 aa29.06■■■□□ 2.24
MFGE8-202ENST00000268151 TOP2BQ02880 1626 aa29.02■■■□□ 2.24
MFGE8-202ENST00000268151 PRDM2Q13029 1718 aa28.98■■■□□ 2.23
MFGE8-202ENST00000268151 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.97■■■□□ 2.23
MFGE8-202ENST00000268151 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.96■■■□□ 2.23
MFGE8-202ENST00000268151 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.93■■■□□ 2.22
MFGE8-202ENST00000268151 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.92■■■□□ 2.22
MFGE8-202ENST00000268151 CUX1P39880 1505 aa28.88■■■□□ 2.21
MFGE8-202ENST00000268151 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.86■■■□□ 2.21
MFGE8-202ENST00000268151 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.75■■■□□ 2.19
MFGE8-202ENST00000268151 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.73■■■□□ 2.19
MFGE8-202ENST00000268151 NESP48681 1621 aa28.69■■■□□ 2.18
MFGE8-202ENST00000268151 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.69■■■□□ 2.18
MFGE8-202ENST00000268151 GOLGA3Q08378 1498 aa28.68■■■□□ 2.18
MFGE8-202ENST00000268151 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.66■■■□□ 2.18
MFGE8-202ENST00000268151 KIF21BO75037 1637 aa28.64■■■□□ 2.18
MFGE8-202ENST00000268151 KIF27Q86VH2 1401 aa28.58■■■□□ 2.17
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MFGE8-202ENST00000268151 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.53■■■□□ 2.16
MFGE8-202ENST00000268151 CEP162Q5TB80 1403 aa28.52■■■□□ 2.16
MFGE8-202ENST00000268151 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.49■■■□□ 2.15
MFGE8-202ENST00000268151 TOPBP1Q92547 1522 aa28.47■■■□□ 2.15
MFGE8-202ENST00000268151 PRXQ9BXM0 1461 aa28.46■■■□□ 2.15
MFGE8-202ENST00000268151 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
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MFGE8-202ENST00000268151 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.42■■■□□ 2.14
MFGE8-202ENST00000268151 CUX2O14529 1486 aa28.41■■■□□ 2.14
MFGE8-202ENST00000268151 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
MFGE8-202ENST00000268151 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
MFGE8-202ENST00000268151 IGF1RP08069 1367 aa28.31■■■□□ 2.12
MFGE8-202ENST00000268151 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.3■■■□□ 2.12
MFGE8-202ENST00000268151 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.28■■■□□ 2.12
MFGE8-202ENST00000268151 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.26■■■□□ 2.12
MFGE8-202ENST00000268151 CLIP1P30622 1438 aa28.24■■■□□ 2.11
MFGE8-202ENST00000268151 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.17■■■□□ 2.1
MFGE8-202ENST00000268151 HRCP23327 699 aa28.16■■■□□ 2.1
MFGE8-202ENST00000268151 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.13■■■□□ 2.09
MFGE8-202ENST00000268151 WDR97A6NE52 1622 aa28.1■■■□□ 2.09
MFGE8-202ENST00000268151 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.03■■■□□ 2.08
MFGE8-202ENST00000268151 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
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MFGE8-202ENST00000268151 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.99■■■□□ 2.07
MFGE8-202ENST00000268151 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
MFGE8-202ENST00000268151 CUL7Q14999 1698 aa27.98■■■□□ 2.07
MFGE8-202ENST00000268151 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.97■■■□□ 2.07
MFGE8-202ENST00000268151 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
MFGE8-202ENST00000268151 WDR62O43379 1518 aa27.96■■■□□ 2.07
MFGE8-202ENST00000268151 ERCC6Q03468 1493 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-202ENST00000268151 ARAP1Q96P48 1450 aa27.9■■■□□ 2.06
MFGE8-202ENST00000268151 IFT140Q96RY7 1462 aa27.85■■■□□ 2.05
MFGE8-202ENST00000268151 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.85■■■□□ 2.05
MFGE8-202ENST00000268151 APLP2Q06481 763 aa27.8■■■□□ 2.04
MFGE8-202ENST00000268151 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
MFGE8-202ENST00000268151 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.035e-7■■■■■ 32.3
MFGE8-202ENST00000268151 GRIN2BQ13224 1484 aa27.72■■■□□ 2.03
MFGE8-202ENST00000268151 PBRM1Q86U86 1689 aa27.7■■■□□ 2.02
MFGE8-202ENST00000268151 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
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