Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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