Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms