Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
RAD54L2Q9Y4B4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RAD54L2Q9Y4B4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
RAD54L2Q9Y4B4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RAD54L2Q9Y4B4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
RAD54L2Q9Y4B4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
RAD54L2Q9Y4B4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RAD54L2Q9Y4B4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RAD54L2Q9Y4B4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 330.1 ms