Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF18Q9UNG2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFSF18Q9UNG2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms