Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO4Q9UKT5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO4Q9UKT5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms